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Ordenação heráldica do brasão e bandeira
Estabelecida em reunião de Assembleia Municipal, em 25/06/1986
Publicada no Diário da República n.º 181, 3.ª Série, Parte A de 08/08/1986
Armas - De prata, dois sáveis a azul, contra-nadantes e ferrados a uma armação de rio, de negro e acompanhados em orla de oito anzóis de vermelho. Coroa mural e quatro torres de prata. Listel branco, com a legenda : "São João da Pesqueira", a negro.

Bandeira - Esquartelada de azul e branco. Cordões e borlas de azul e prata. Haste e lança douradas.
Segunda proposta de ordenação heráldica do brasão e bandeira
Segundo o parecer da Comissão de Heráldica e Genealogia da Associação dos Arqueólogos Portugueses de 28/10/1967
Não adoptada pelo município.
Armas - De prata, com um golfinho de azul. Coroa mural de prata de quatro torres.*

Bandeira - De prata, com um golfinho de azul. Coroa mural de prata de quatro torres.*
* Fonte - Carta pela A.A.P. enviada à Câmara Municipal de S. João da Pesqueira em 19/12/1970 - Registo de correspondência expedida da Associação dos Arqueólogos Portugueses - Arquivo da Associação dos Arqueólogos Portugueses

Primeira proposta de ordenação heráldica do brasão e bandeira
Segundo o parecer da Comissão de Heráldica da Associação dos Arqueólogos Portugueses de 03/11/1937
Não adoptada pelo município.
Armas - De azul com um cacho de uvas de púrpura folhado e sustido de ouro, acompanhado por um ramo de oliveira e por uma espiga de trigo folhada, tudo de ouro e atados em ponta de vermelho. No chefe e no contrachefe, duas faixas ondadas de prata. Coroa mural de prata de quatro torres. Listel banco com os dizeres “Vila de S. João da Pesqueira” a negro.*

Bandeira - Esquartelada de amarelo e de púrpura. Cordões e borlas de ouro e de púrpura. Lança de haste de ouro.*
* Fonte - Acta n.º 16 - Livro de actas das reuniões da Comissão de Heráldica da Associação dos Arqueólogos Portugueses - 1933-1937 - Arquivo da Associação dos Arqueólogos Portugueses
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